Após a fusão, o clube fez o seu representante na Primeira Divisão, mas declinou na primeira fase devido à forte ⭕️ concorrência de clubes do Brasil, incluindo Cruzeiro, Atlético Paranaense e Grêmio.

Nos anos 2000, disputou o Módulo II, mas não alcançou ⭕️ o "major" do campeonato, o que lhe permitiu disputar competições menores e sem acesso à divisão principal.

Na 2ª divisão, retornou ⭕️ à Primeira divisão após uma queda para o Grêmio, que tinha acabado de se fundir com o futebol inglês.

Em 2001, ⭕️ o Atlético Mineiro foi à final da Copa do Brasil.

Naquele ano, o clube