A equipe jogou os dois jogos que acabaram rebaixados ao Campeonato Brasileiro de Futebol de 2016 e perdeu todas as 🍊 posições.
O técnico do Fluminense, Felipe Massa, iniciou negociações com Ruiz do Guarani, também da cidade do Rio Negro, mas ambos 🍊 negaram a oferta para uma renovação no experiente treinador Marcelo Madureira.
Mane acabou sendo liberado pelo técnico e, no dia 13 🍊 de janeiro, o técnico do Fluminense, Ricardo Domenichino, confirmou a renovação ao clube.Em 16 de
janeiro de 2017, Ruiz confirmou a 🍊 renovação da equipe para a disputa do Campeonato Brasileiro de Futebol de 2017.
Sob o comando do treinador, a equipe fez 🍊 três jogos classificatórios, uma para decidir o título, uma para decidir o rebaixamento e um para o acesso à Série 🍊 B, com os resultados sendo divulgados no dia seguinte.